Родился в 1854 году в семье русских молокан в молоканском селе Воронцовке недалеко от города Тифлиса (Закавказье).

Позже семья переселилась в Тифлис, где отец трудился извозчиком. Получив начальное образование, с отроческих лет в помощь отцу стал работать в магазине сначала мальчиком, а позже — продавцом. Близкое знакомство с первым русским баптистом Ворониным Н.И. способствовало его духовному возрождению, и в апреле 1871 года он в шестнадцать лет принял святое крещение по вере от Воронина Н.И., войдя, таким образом, в число первых десяти членов первой русской общины баптистов. Его родители стали членами церкви позже, в 1876 году.

Рано также пробудилась у него любовь к иностранным языкам, и он начал изучение немецкого и древнееврейского, посещая для этого еврейскую школу для мальчиков — хедер. В I875 году он, по предложению М. Кальвейта, поехал в Гамбург, чтобы подготовиться к проповедническому служению. В то время там не было еще семинарии и миссионерской школы, но И. Г. Онкен принял его и назначил одного брата для обучения Павлова.

Василий родился 13 августа 1846 года. В 1852 году его отец основал в Елисоветопольской губернии селении Новоивановку где Василий проведёт своё детство и большую часть жизни.

Отец Василия —  Ефим Трефилович Клышников, был активным молоканином. Молокане – это русские люди, которые отказались от религиозной обрядности и старались строить свою жизнь исключительно на Библии, так как они понимали её. Вместе с обрядностью, они отвергли учение о духовном возрождении, крещении, хлебопреломлении. Спасались они праведной жизнью по Слову Божьему. Царское правительство в разное время по разному относилось к молоканам. Были времена жёстких преследований и ссылок. Молоканам разрешали селится в определённых районах в основном на окраинах Империи. Отец и дед Василия снискали большую славу среди молокан за своё благочестие и знание Священного Писания. Преследуемый царским правительством, Ефим Трефилович Клышников бежал из Тамбовской губернии в Закавказье, где жил и работал до самой смерти своей под чужим именем Василия Семеновича Иванова. Именно поэтому у его сына и внука двойная фамилия.

Мартин Кальвейт 20 августа 1867 года крестил первого русского баптиста Никиту Исаевича Воронина.

Мартин Кальвейт родился в семье лютеран в 1833 г. В литовском городке Тоураге в Ковельской губ., около самой прусской границы, которая жила в большой бедности. Отец был крестьянин, мать умерла, когда мальчику не было и года. Из-за отсутствия в городке школы он остался без школьного образования, — недостаток, который он ощущал всю жизнь. В 13 лет отец отдал мальчика «в люди» на два года. Через некоторое время он по совету старшей сестры начал изучать токарное дело. Он вернулся в родной город и там устроился работать на мельнице, его взяла к себе жить большая семья по фамилии Вал. Как раз в тот момент, когда Мартин попал в эту семью там происходило духовное пробуждение.